BerlinUP und seine Trägereinrichtungen sind regional, national und international vernetzt und unterstützen die Open-Access-Transformation durch Mitarbeit und Mitgliedschaft in zahlreichen Projekten, Gremien und Initiativen. Weitere Kooperationen, die dem übergeordneten Ziel wissenschaftseigener und -adäquater Publikationsstrukturen dienen, begleiten den schrittweisen Aufbau und Betrieb von BerlinUP.

Von besonderer Bedeutung für die nachhaltige und qualitätsgesichterte Weiterentwicklung von BerlinUP sind dabei die Mitgliedschaft in der AG Universitätsverlage sowie die Zusammenarbeit mit dem Projekt open-access.network und den Entwickler*innen-Communities von OJS-de.net und DSpace.